При реализации имущественных прав (долей, паев) в расходы можно включить цену приобретения данных имущественных прав (долей, паев)  и сумму расходов, связанных с их приобретением и реализацией (ст.268 НК РФ).

Следовательно, если расходы на приобретение доли превышают доходы от ее реализации, то разница признается убытком налогоплательщика, учитываемым в целях налогообложения (п. 2 ст. 268 НК РФ).

Аналогичное мнение – в письмо Минфина России от 17.07.2012 N 03-03-06/1/336.